胃肠道是动物机体主要消化吸收器官，肠胃受损会直接影响到营养物质的消化和吸收，最终导致饲料转化率变差；胃肠道还是体内最大的免疫器官也是局部粘膜的第一道免疫防线，受损后免疫功能下降，对疾病的抵抗力变差，成为极易感动物。
据调查统计很多疾病都直接或间接与消化道有关，所以维护肠道健康，保持胃肠菌群平衡是保障机体免疫力的重要一环。蛋鸡胃肠道问题较为复杂，与多种因素有关，在养殖生产中应多注意以下环节。
一
营养因素
保证饲料的营养搭配均衡
由于日粮配比不平衡、谷物过多（如小麦、糠麸）、饲料中淀粉和蛋白过高等都会影响饲料消化和延缓粪便排空时间，给一些肠道病原微生物的繁殖提供机会，因此合理的配比可降低感染病原微生物的机率，使用预混料的养殖户可遵循饲料厂家手册建议进行合理搭配。
选择优质饲料原料
补充优质原料（如玉米、豆粕、鱼粉）有助于保持肠道的自然健康。
添加毒素吸附剂
饲料原料中有毒物质（如霉菌或霉菌毒素）可影响到肠道粘膜的完整性，在饲料中定期添加霉菌毒素吸附剂可与饲料物质中的霉菌或霉菌毒素结合或吸附消除这些物质对肠道的损害。
二
加强饲养管理
重视雏鸡阶段饲养
消化道及参与消化的器官很多大比例发生在生长早期，如果在这一阶段消化生长停滞，整个的生长速度就会受到损害。此外，新出雏的鸡由于防御系统发育不健全，容易发生肠道感染。所以在这一阶段应加强肠道的保健。育雏条件和高质量的育雏料，对雏鸡早期至关重要；雏鸡到达养殖场后应尽快地喂料、给水，并保证鸡群有充足的饮水和采食，这样有助于消化系统的发育。
检查小雏鸡的素囊充满度，是评估早期育雏管理的最好指针，舍后24小时，至少95％的雏鸡拥有大约10毫米大小的稀软的嗉囊。如果嗉囊是空的、只有水或者只有饲料，那么说明早期育雏管理存在严重问题，因此雏鸡实现良好和均匀的早期生长对功能健全的消化系统是至关重要。
减少应激
许多应激因素都可以改变家禽肠道环境、影响家禽肠道的完整性，如抓鸡、运输、拥挤、环境改变等。
三
重视生物安全
加强环境消毒
目前证实有多种病毒可破坏肠道粘膜引起肠炎症状；如轮状病毒、冠状病毒、细小病毒、肠病毒等。另外大多数肠炎病毒生命力强，难以消灭，有鸡只排泄物存在时，病毒在环境中的稳定性和对消毒剂的抵抗力增强；而解决行之有效的方法主要是空舍期间的彻底清洗消毒和带鸡消毒，以便于降低鸡舍病原微生物含量。
饮水系统清洗
定期对饮水系统如水箱、水线彻底清洗消毒，避免饮水系统二次污染。饮水质量绝大数是损害肠道因素的载体，主要是饮用水矿物质含量高和微生物超标。并且这些物质可与水中维生素等药物结合产生不溶性物质(水垢、生物膜)导致饮水系统二次污染，破坏肠道菌群结构，造成菌群失调，导致鸡群腹泻。
四
维护肠道关键点控制
球虫病控制
球虫病一直是全球最普遍和经常报道的影响家禽肠道健康和生长效率的疾病之一。但很多养殖场往往低估球虫病的亚临床感染，一旦球虫卵囊亚临床感染后对对肠道壁的损伤非常大。清洗、消毒和生物安全措施并不能完全有效预防球虫病，但在减轻球虫早期感染方面是重要的，所以要根据具体情况（特别是开产前）添加些抗球虫药物进行预防，以防止球虫病亚临床感染。
确保肠道正常的菌群微环境
由不同的微生物菌群构成的肠道微环境是保证动物肠道功能正常的重要因素。正常情况下，乳酸菌等有益菌在肠道中占据优势地位，并通过竞争抑制保护肠道上皮细胞免受外界病原菌的伤害，协助肠道提高对营养物质的消化和吸收。但是在应激等多种因素的持续存在，会对菌群平衡产生不同程度的破坏，为充分发挥有益菌在保护肠道和促进消化方面的积极作用，提高动物抗应激能力，减少抗菌药物使用是根本措施，同时，通过选择性的补充些微生态制剂，也是确保肠道菌群稳定正常的有效手段。
